再适当补充新鲜的干垫料于表面，目的是中和水份；具体补充多少干垫料，看情况而定，过湿的就多补一点，不过湿的，多少也补充一点。补充菌种，每立方米补充20克以上的干撒式发酵床菌种，按1：10的比例掺半玉米粉，然后均匀补充到垫料中。操作顺序是：先人工喷雾绿陇微生物除臭剂溶液，完毕后，撒上补充的碳能量如葡萄糖或玉米粉（葡萄糖和玉米粉也可以掺到除臭消毒剂溶液中一起搅拌泼洒），然后撒入补充的干垫料于表面，然后撒绿陇干撒式发酵床菌种（菌种可以掺到补充的干垫料中一起搅拌撒入），较后，开动翻耙机翻耙垫料。连续对整个发酵床垫料翻耙两次处理，继续观察恢复情况，一般均可以得到恢复。
不仅如此，异位发酵床内的垫料产生的有机质含量可达35%以上，可加工成高端有机肥，用于替代传统化肥，经济效益甚至超过猪肉的价值。养殖业是巨大的污染源，也是巨大的有机肥料库。总的来说，做发酵床治污的成本远远低于以前的工业治污、沼气池等方式，工业化处理废污是只能投入，基本上没有回收，但发酵床治污不仅只是投入，出售有机肥、处理的可用粪水灌溉冲施肥等都是可为养殖户回收成本，并带来经济效益的方式。
翻耙机可有效解决养殖废弃物资源化利用:翻耙机是一种简易的槽式翻抛机，它的工作流程是养猪场通过干清粪的方式，将集中存储在集污池中，而发酵堆肥槽距离猪舍不远，一般根据养殖规模的多少，按照4米宽做土建，在发酵槽中预先做好垫料，通过集污管道，喷淋系统均匀喷洒在发酵槽的垫料上，并喷洒好菌种，在翻耙机的来回搅拌翻耙下，实现粪污的降解，但是要记住一点，翻耙机的翻耙深度有限达不到槽式翻抛机的深度，一般情况下，翻耙机的深度在70~90cm，因此在建设发酵槽时要注意。
