当易碎生物或物料的交叉污染会危及产品降雨或人身安全时，还应采取安全可靠的技术措施防止交叉污染，如严格控制不同选定GMP车间净化之间的静压差，合理划分净化空调系统，按要求合理设计回风系统等。GMP车间净化的设计是各种专业设计技术的综合，尤其是GMP车间净化的工艺设计、洁净建筑设计、空气净化设计以及各种有特殊要求的设计技术的综合设计，紧密配合，相互渗透，合理安排。GMP车间净化工程设计应符合工艺(或使用)流程。
净化工程中的环境应保持一定的湿度。比如中国北方，由于冬季天气干燥，静电导致的事故或故障比沿海地区高。因此，在一些净化工程中要考虑湿度要求，如机房、实验室、化工车间、制药车间等。应特别注意封闭的空调房。在这些净化项目中更要注意湿度，一般要增加控制湿度的净化设备。还可以要求技术工人在操作时佩戴防静电手套，也可以有效防止静电的产生。将一些导体或半导体器件放入各种抗静电塑料制成的抗静电器皿中，可以有效防止静电的产生。如果条件允许，也可以将设备放入金属器皿中。
一般情况下，内门通常只沿门缝设置一圈密封条，一条密封线就够了。而材料人群的外门和洁净车间的生产区直接通向外门。为了可靠地防止室外空气对人的侵害，除了气闸和双扇门，而且建筑和风机的截面比一般内门大得多，通常用两条密封条形成两道密封线。为了使密封条满足截面小、受力后压缩量大的要求，并与受压构件有足够的接触和良好的密封条件，通常制成不同种类的橡胶空心薄壁异型管；而且大部分都是成型品。有多种截面形式，嵌入位置和方式不同。
