牛粪等农家肥可适当多施；饼和鸡鸭粪的施用量要控制。露地蔬菜有机肥施用量可略少，大棚蔬菜有机肥施用量应适当增加。成都蔬菜有机肥的用量，如营养土、猪牛粪等，备苗不应超过总量的三分之一。对于大多数蔬菜品种和中等肥力土地，每茬667平方米露地可施猪牛粪等有机肥2000 ~ 3000公斤，每茬蔬菜大棚可施有机肥4000 ~ 5000公斤。有条件时，植物有机肥的施用量应占总施肥量的50 ~ 60%。
有机肥的科学施用。 有机肥适合做基肥施用。菜地不要施未腐熟的有机肥。有机肥要深施于土壤，不要施于畦面，以免养分淋失。在翻耕菜地前，应先撒施所需的有机肥，然后翻耕1 ~ 2次，可有效保持和延长有机肥的肥力。在种植蔬菜前，将有机肥埋在种植沟或种植穴中，种植前用薄土覆盖，具有保肥和延长供肥期的良好效果。
冬春低温，发酵50-60天即可分解。牛粪等猪粪密闭发酵时，前期较高温度可达60 ~ 70℃。此外，肥料中的大多数病原微生物、害虫、虫卵、杂草种子等会因密闭发酵造成的缺氧和大量有毒气体而被杀死。 如果有沼气池，可以把未消化的猪、牛、人畜粪便放进去，让它发酵产气，然后用沼渣、沼液给蔬菜施肥，生态环保。