大部分保护区都是封闭设施，成都环保有机肥在分解过程中释放的大量二氧化碳成为光合作用的重要原料来源。而且多施有机肥可以提高冬季大棚土壤的温度，对于冬季大棚生产暖菜非常珍贵。 长期施用有机肥可以提高植物的抗逆性和抗病性，保持蔬菜生产的高产稳产。
冬季低温季节种植大棚蔬菜时，部分种植户会施用半腐熟猪牛粪等有机肥。记住蔬菜的根系不要直接接触这种有机肥，肥料要和根系保持一定距离，防止肥料伤害和根系灼伤。乐山蔬菜有机肥与化肥配施可大大提高肥效、肥效持久性，提高蔬菜产量和品质。
冬春低温，发酵50-60天即可分解。牛粪等猪粪密闭发酵时，前期较高温度可达60 ~ 70℃。此外，肥料中的大多数病原微生物、害虫、虫卵、杂草种子等会因密闭发酵造成的缺氧和大量有毒气体而被杀死。 如果有沼气池，可以把未消化的猪、牛、人畜粪便放进去，让它发酵产气，然后用沼渣、沼液给蔬菜施肥，生态环保。